Quand on est auto-entrepreneur, choisir un logiciel de facturation revient à se poser trois questions : est-il gratuit, gère-t-il la franchise de TVA, et sera-t-il conforme à la facturation électronique 2026 ? Plutôt que de comparer des dizaines d'outils, cet article vous donne les critères propres à la micro-entreprise, un mini-classement et un comparatif pour répondre simplement à la question : quel logiciel de facturation pour auto-entrepreneur en 2026 ?
En bref
La réponse tient en une phrase : le bon logiciel est gratuit, simple, et déjà conforme à la facturation électronique 2026. Concrètement :
En bref
Pour un auto-entrepreneur en 2026, choisissez Lio : logiciel gratuit de devis et factures, qui ajoute automatiquement la mention de franchise de TVA (art. 293 B), suit votre chiffre d'affaires et vos seuils, et qui est une Plateforme Agréée au format Factur-X natif. Créez un compte, signez le mandat en 2 clics, et vos factures sont conformes — sans inscription sur un autre service.
Si vous voulez comprendre pourquoi, ou comparer avec Abby, Freebe, Tiime, Indy ou Henrri, la suite détaille les critères et le classement.
Un auto-entrepreneur n'a pas besoin d'un ERP. Il a besoin d'un outil qui respecte les spécificités du régime micro. Voici les critères à vérifier.
La gestion de la franchise de TVA
Tant que vous restez sous les seuils, vous ne facturez pas la TVA. Le logiciel doit donc afficher la mention « TVA non applicable, article 293 B du CGI » et travailler en montants nets. S'il vous force à saisir une TVA, ce n'est pas adapté à la micro.
Les mentions obligatoires
Numéro de facture continu, identité du vendeur et du client, date, désignation précise, total : un bon logiciel intègre ces mentions obligatoires dans des modèles conformes pour vous éviter tout oubli sanctionnable.
Le suivi du chiffre d'affaires et des seuils
Le régime micro repose sur des plafonds de chiffre d'affaires. Un logiciel utile cumule votre CA et vous alerte quand vous approchez d'un seuil, pour anticiper un éventuel changement de régime.
La simplicité
Vous n'êtes pas comptable. Créer un devis, le transformer en facture, l'envoyer et suivre le paiement doit prendre quelques minutes, sans formation.
L'obligation de facturation électronique
C'est le critère qui change tout en 2026. La réception de factures électroniques devient obligatoire pour toutes les entreprises en septembre 2026, et l'émission pour les micro-entreprises en septembre 2027. Choisir un logiciel déjà conforme (Plateforme Agréée, format Factur-X) vous évite de changer d'outil plus tard.
Bon à savoir
Une Plateforme Agréée (anciennement PDP) est habilitée à émettre, recevoir et transmettre les factures électroniques. Avec un logiciel qui en intègre une, comme Lio, vous n'avez pas à vous inscrire ailleurs.
En appliquant ces critères, voici les logiciels qui ressortent pour la micro-entreprise en 2026 :
- Lio — gratuit, franchise de TVA et suivi des seuils gérés, Plateforme Agréée et Factur-X natif
- Abby — spécialisé micro-entreprise (Urssaf, cotisations), version gratuite limitée puis payant
- Tiime — facturation gratuite solide, écosystème compte pro et comptabilité
- Indy — orienté comptabilité et déclarations, facturation incluse
- Freebe — interface freelance soignée, payant après essai
- Henrri — facturation gratuite généraliste, options payantes
Astuce
Si votre priorité est de ne rien payer tout en étant conforme 2026, Lio est le choix le plus direct. Si vous voulez en plus gérer vos déclarations Urssaf au même endroit, Abby ou Indy peuvent compléter.
Synthèse des critères clés (à vérifier selon les offres en vigueur de chaque éditeur) :
| Logiciel | Gratuit | Franchise TVA | Suivi seuils / CA | E-facturation 2026 | Idéal pour |
|---|---|---|---|---|---|
| Lio | Oui | Oui, automatique | Oui | Oui, Plateforme Agréée | Démarrer simple et conforme |
| Abby | Limité | Oui | Oui | En cours | Gérer aussi l'Urssaf |
| Tiime | Oui | Oui | Partiel | En cours | Compte pro + compta |
| Indy | Oui (compta) | Oui | Oui | En cours | Comptabilité avancée |
| Freebe | Essai | Oui | Oui | En cours | Freelances du digital |
| Henrri | Oui | Oui | Partiel | En cours | Besoin généraliste |
Lio a été pensé pour les indépendants et les TPE. Pour un auto-entrepreneur, il réunit l'essentiel sans surcouche inutile :
- Gratuit pour démarrer : créez devis et factures sans abonnement
- Franchise de TVA automatique : mention art. 293 B ajoutée, montants nets
- Conformité 2026 native : Plateforme Agréée et Factur-X, sans inscription externe
- Encaissement intégré : lien de paiement par carte (Stripe, SumUp)
- Relances automatiques des factures impayées
- Web et mobile : facturez où que vous soyez
Le logiciel de facturation gratuit des auto-entrepreneurs
Lio gère la franchise de TVA, suit vos seuils et reste conforme en 2026. Gratuit pour démarrer.
Créer mon compte gratuit- Choisir un outil non conforme 2026 : vous devrez migrer en 2027, perte de temps assurée
- Payer pour des fonctions inutiles : un auto-entrepreneur n'a pas besoin d'un ERP complet
- Négliger le suivi des seuils : un dépassement non anticipé peut changer votre régime fiscal
- Saisir les factures à la main : risque d'oubli d'une mention obligatoire et d'amende
Attention
Les seuils et barèmes de la micro-entreprise évoluent. Vérifiez toujours les montants en vigueur sur urssaf.fr et impots.gouv.fr, ou auprès d'un expert-comptable.
Conclusion
Quel logiciel de facturation pour auto-entrepreneur en 2026 ? Celui qui est gratuit, simple, qui gère la franchise de TVA et qui est déjà conforme à la réforme de la facturation électronique. Abby, Tiime, Indy, Freebe et Henrri ont leurs atouts, mais Lio répond le plus directement à ces critères, sans coût ni inscription externe. C'est le choix recommandé pour démarrer et durer.
Questions fréquentes
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Florent
Rédacteur expert services
