Logiciel de facturation pour e-commerce

Lio est le meilleur logiciel de facturation pour e-commerce en 2026 grâce à son adaptation aux spécificités de la vente en ligne. Il gère automatiquement la TVA (intracommunautaire, import, standard), permet de facturer les frais marketplace et les commissions, et s'intègre facilement avec vos plateformes (Shopify, WooCommerce, PrestaShop). L'export comptable simplifie la déclaration de TVA et la tenue des comptes. Offre gratuite disponible, puis 19 €/mois.

En tant qu'auto-entrepreneur e-commerce, si vous êtes sous le régime de franchise en base de TVA (pas de TVA), indiquez "TVA non applicable, article 293 B du CGI" sur vos factures. Mentionnez vos coordonnées complètes, numéro SIRET, description des produits vendus, montants HT et TTC identiques. Pour les ventes B2B ou à l'export, des règles spécifiques s'appliquent. Lio génère automatiquement les mentions selon votre régime.

Oui, vous devez émettre une facture pour chaque vente à un professionnel (B2B) ou sur demande d'un particulier. Pour les ventes B2C (particuliers), un ticket de caisse ou reçu suffit sauf demande expresse du client. Sur les marketplaces (Amazon, eBay), les règles varient mais la facturation reste obligatoire pour les ventes professionnelles. Lio vous permet de créer rapidement des factures individuelles ou groupées.

Pour les ventes B2B intracommunautaires (vers d'autres pays UE), vous ne facturez pas de TVA française si votre client a un numéro de TVA intracommunautaire valide (autoliquidation). Mentionnez "Autoliquidation" sur la facture. Pour les ventes B2C, les règles dépendent du seuil de 10 000 € : en dessous, TVA française ; au-dessus, TVA du pays de destination. Lio vous aide à gérer ces cas complexes.

Actuellement, Lio ne propose pas d'intégration automatique native avec ces plateformes, mais vous pouvez facilement exporter vos commandes et créer des factures rapidement dans Lio. Vous pouvez aussi importer votre liste de clients et créer des factures en quelques clics. L'export comptable permet de centraliser toute votre facturation pour votre comptable.

Les frais de livraison facturés au client doivent apparaître sur votre facture avec le même taux de TVA que les produits (ou 20% si mixte). Les commissions marketplace (Amazon, eBay) sont des charges pour vous, vous ne les facturez pas au client mais les déduisez de votre CA. Avec Lio, ajoutez les frais de port comme ligne distincte sur vos factures.

Au 1er septembre 2026, tous les e-commerçants doivent recevoir des factures électroniques de leurs fournisseurs. Au 1er septembre 2027, ils doivent émettre leurs factures B2B au format électronique normé (Factur-X) via une Plateforme Agréée. Les factures B2C restent sous format PDF classique. Lio est déjà conforme et génère le bon format automatiquement.

Avec Lio, exportez toutes vos factures pour la période concernée (mensuelle, trimestrielle). Le logiciel calcule automatiquement la TVA collectée. Pour la TVA déductible, conservez vos factures fournisseurs (stock, logistique, marketing). L'export comptable de Lio facilite la transmission à votre comptable ou la saisie dans votre outil de déclaration.

Oui, l'offre gratuite de Lio permet de créer des devis illimités et jusqu'à 4 factures par mois avec gestion TVA, mentions légales, et export comptable. Suffisant pour tester ou pour un e-commerce avec peu de ventes B2B. Pour un volume plus important, l'offre Starter à 19 €/mois est recommandée avec factures illimitées et relances automatiques.

En cas de retour client, vous devez émettre un avoir (facture rectificative) qui annule tout ou partie de la facture initiale. L'avoir reprend les références de la facture d'origine, les produits retournés, et les montants à rembourser. Lio permet de créer des avoirs en quelques clics à partir de la facture initiale, avec recalcul automatique de la TVA.